1、网络风险

在信息技术的协助下, ERP系统在企业发展中的应用构建了一种全新的管理模式, 使管理思维、企业文化、运营形式与营销理念均有所改变。ERP系统在运行期间动态性特征显著，使企业在管理过程中面对较大的网络安全风险，这主要是因为网络环境具有开放性, 在市场竞争激烈的局势中，很多不法分子为了谋得私利而对ERP系统产生恶意攻击行为, 使企业财务信息的完整性遭到破坏, 企业蒙受不必要的损失。

2、技术风险

ERP系统在企业管理期间的应用, 可以被视为管理人员对组织结构、生产与业务程序进行再度重组的过程。因为ERP系统管理模式和软件系统间存在较大关联性，故此再度重组效果难以得到有效保证。此外，ERP系统通常被应用于制造企业管理进程中，但是没有在服务行业中普及应用，这间接的说明其可能存在一些技术缺陷。

3、投资风险

投资是现代企业在运营过程中常见的一类经济行为, 在竞争日益激烈的市场环境中, 市场运行模式对企业投资活动产生的影响是极为深刻的。ERP系统在企业管理中的应用, 通常会投入大量的建设资金, 故此为了提升企业管理效果, 应以企业发展现状为基点, 对ERP功能进行合理选用, 进而对企业各项业务运行规范性进行强化。当下, 国内ERP系统功能模式固定性显着, 无法适用于不同规模、不同运营性质的企业中, 投资风险随即出现。